In 3HE-Systemen gibt es hierzu auch zwei Möglichkeiten, entweder über eine doppelt breite CPU, die in einem CompactPCI-Systemslot gesteckt wird und eine Mezzanine-Karte hat, die in den CompactPCI-Serial-Systemslot eingesteckt wird. Oder aber es wird ein CompactPCI-PlusIO-Systemslot gewählt, der sowohl CompactPCI- als auch CompactPCI-Serial-Peripherieslots ansprechen kann. Hier gibt es jedoch eine Begrenzung der seriellen Slots auf vier.

Im 6HE-System kann eine Anbindung an CompactPCI und an CompactPCI Serial auf einer 4TE-Karte erfolgen. Dabei ist CompactPCI Serial so gewählt, dass die seriellen Signale in den oberen 3HE der Karte untergebracht sind. Die unteren 3HE können mit dem CompactPCI-Interface ausgestattet werden. Mit solch einer hybriden CompactPCI-/CompactPCI-Serial-CPU können bis zu sieben CompactPCI- und acht CompactPCI-Serial-Peripherieslots angesprochen werden.

Auch mehrere „Mixed Slots“ (Karten mit Anschluss an CompactPCI und CompactPCI Serial) sind in einem Chassis möglich. So können mehrere Karten gleichzeitig auf den parallelen PCI Bus und die schnellen seriellen Protokolle zugreifen.

Mit der entsprechenden Backplane sind durch diese Flexibilität der CompactPCI-Serial-Spezifikation unterschiedlichste Möglichkeiten gegeben. So können alte 6HE-CompactPCI- oder Packet-Switching-Karten mit hybriden CompactPCI-/CompactPCI-Serial-Karten und reinen CompactPCI-Serial-Karten in einem System kombiniert werden. Das GbE der Packet-Switching-Karten kann dabei sogar direkt an das Ethernet von CompactPCI Serial angeschlossen werden.

So kann zum Beispiel ein Packet-Switching-System um ein CompactPCI-Serial-Storage-Raid-System erweitert werden. Die Festplatten werden auf den CompactPCI-Serial-Karten untergebracht, sind von der Prozessorkarte direkt über Serial-ATA oder SCSI ansprechbar und können im laufenden Betrieb gesteckt bzw. gezogen werden. Oder es kann ein langsames 6HE I/O Board auf CompactPCI-Basis ganz einfach an ein schnelles CompactPCI-Serial-System angeschlossen werden. Hiermit sind die Grundlagen für die Hochleistungssysteme der Zukunft geschaffen.