Die ursprüngliche CompactPCI-Architektur basiert auf einem parallelen Bus, der den Systemslot mit den Peripherieslots verbindet. PICMG 2.16 als Erweiterung von CompactPCI führte dann neben dem parallelen PCI-Bus als weiteres Übertragungsmedium Ethernet auf der Backplane ein. CompactPCI Express wendet sich ganz vom parallelen PCI-Bus ab und basiert ausschließlich auf PCI-Express als schneller serieller Punkt-zu-Punkt-Verbindung.

Einen anderen Weg der Symbiose der verschiedenen Architekturen stellt PICMG 2.30 CompactPCI PlusIO dar. Der neue Standard (derzeit Draft), erweitert CompactPCI um PCI-Express, Etherent, SATA/SAS und USB. Er unterstützt also gleichzeitig PCI-Bus als auch die modernen, seriellen, schnellen Interconnects. Neben PCI-Express erweitert er CompactPCI um Ethernet für Multiprocessing.

Zum Aufbau von Raid-Festplattensystemen steht außerdem SATA/SAS zur Verfügung. Und USB bietet sich zur Ansteuerung von Funkmodulen an (WiFi etc.). Die Signale werden auf den User-I/O-Pins von J2 herausgeführt, so dass CompactPCI PlusIO auch für Einfacheuropakarten genutzt werden kann. Die Möglichkeit der 64-Bit-Kommunikation auf dem Legacy-PCI-Bus entfällt damit allerdings.

In der PICMG bereitet eine Arbeitsgruppe CompactPCI Serial vor. CompactPCI Serial greift die Architektur von CompactPCI PlusIO auf, verzichtete jedoch auf den PCI-Bus. Ein dichterer Steckverbinder, der für noch höhere Übertragungsraten geeignet ist, erlaubt die Ansteuerung von bis zu neun Slots. Dabei kann aber ganz auf Bridges und Switches verzichtet werden.

CompactPCI Serial entspricht der Architektur der Chipsätze aus dem Mobile- und Server-Bereich der nächsten Jahre. Der PCI-Bus kann über einen doppelt breiten Systemslot angesteuert werden. Die Peripherie-Boards von CompactPCI Serial sind zu CompactPCI PlusIO kompatibel. CompactPCI entwickelt sich weiter. Die Architektur passt sich modernen Chipsätzen an. Die bewährte Mechanik der IEC 1101 bleibt erhalten. Existierende Boards können weiter verwendet werden. CompactPCI zusammen mit den Ergänzungen PlusIO und Plus ist eine zukunftssichere Plattform für industrielle Rechner.